工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博(bó )士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！